Je to otázka osobních preferencí, ale pokud se potřebuji přihlásit někam ke státu, tak já mám mnohem častěji po ruce ten token, než mobil - a nemusím se starat o jeho nabíjení nebo aktualizaci aplikace.
Navíc, pokud vím, tak MojeID má potvrzovací aplikaci do mobilu také (MojeID klíč).