Pro kvalifikované či uznávané elektronické podpisy jsou nutné kvalifikované certifikáty (nestačí jen ty ne-kvalifikované). Aby je mohl někdo vydávat, musí jeho certifikační autorita projít certifikací a získat kvalifikovaný status (na vydávání kvalifikovaných certifikátů). Což je složité a nákladné, ale není to nerealizovatelné (např. Komerční banka si tím prošla). Další možnost by byla nakupovat kvalifikované certifikáty od někoho jiného. Pro vytváření kvalifikovaných elektronický podpisů je navíc nutné mít soukromé klíče v kvalifikovaném prostředku (zde by to musel být tzv. HSM), což je také dost nákladné. Celkově: jde to, ale má to své nemalé náklady.