Moje zkušenost s certifikáty je taková, že je to běžné nedá se tomu zabránit. Ajťák má v aplikacích pod kontrolou desítky nejrůznějších certifikátů v nejrůznějších formátech a úložištích, podle toho, jak která aplikace to vyžaduje. To ajťák neovlivní. Problém je v tom, že se to mění zřídka - v řádu roků, takže je celkem pravděpodobné, že se mezitím ajťák vymění a k novému se informace nepřenese. Teoreticky by to měla řešit dobrá dokumentce, ale s ní je ten samý problém - jen o úroveň jinde.
Dalším řešením je automatická výměna certifikátů, ale to se běžně nedělá, snad jen u certifikátů web serverů, což byl problém z článku. Ale u certifikátů pro podepisování a jiné účely se aktualizace sama od sebe většinou neprovádí. I kdyby se o to někdo pokusil, pravděpodobnost, že bude dlouhodobě fungovat program, který se uplatní jen jednou za několik roků je malá. V mezidobí se leccos změní a testuje se to také dost obtížně.